学校拥有一支高水平的师资队伍，现有专任教师2678人，其中，教授、副教授1713人，占全职教师总数的64.0％（下同）；拥有博士学位的1918人，占71.6％。学校共有两院院士22人（其中双聘院士10人），国家“973”、国家重大研究计划项目首席科学家7人，中央引进海外高层次人才“千人计划”入选者38人（其中“青年千人计划”入选者10人），“长江学者”特聘教授15人、讲座教授14人，“国家杰出青年科学基金”获得者38人，国家高层次人才特殊支持计划（“万人计划”）科技创新领军人才2人、青年拔尖人才3人，列入国家“百千万人才工程”人选16人，全国高校教学名师奖获得者6人，国务院学科评议组成员10人，列入教育部“新（跨）世纪优秀人才培养计划”151人；国家创新研究群体5个、教育部创新团队7个。

• 一级学科国家重点学科
  理论经济学，工商管理，海洋科学，化学，应用经济学
• 二级学科国家重点学科
  动物学，高等教育学，国际法学，环境科学，基础数学，凝聚态物理，水生生物学，细胞生物学，专门史
• 国家重点（培育）学科
  工商管理，国际法学，高等教育学，专门史，基础数学，凝聚态物理，动物学，水生生物学，细胞生物学，环境科学

• 国家重点实验室
  固体表面物理化学国家重点实验室、近海海洋环境科学国家重点实验室、细胞应激生物学国家重点实验室、分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室
• 教育部重点实验室
  谱学分析与仪器、水声通信与海洋信息技术、滨海湿地生态系统、高性能陶瓷纤维、计量经济学
• 国家工程实验室
  醇醚酯化工清洁生产国家工程实验室
• 国家工程技术研究中心
  国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心
• 教育部人文社会科学重点研究基地
  厦门大学会计发展研究中心、台湾研究中心、东南亚研究中心、高等教育发展研究中心、厦门大学宏观经济研究中心